1. In teilweiser Gutheissung der Beschwerde werden zuhanden des Bundesgerichts die das „Streitpatent 2“ betreffenden Erwägungen des Urteils des
Handelsgerichts des Kantons Zürich vom 26. Februar 2004, insbesondere
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die Erwägungen II/3 a-f, gestrichen.
Im übrigen wird die Beschwerde abgewiesen, soweit auf sie einzutreten ist.

2. Die Gerichtsgebühr für das Kassationsverfahren wird festgesetzt auf:

Fr. 15000.-- ; die weiteren Kosten betragen:
Fr. 394.-- Schreibgebühren,
Fr. 150.-- Zustellgebühren und Porti.