B. Le xxxxx 2009, celle-ci déposa une demande d’autorisation de construire sur le n° uuu. Le projet visait à bâtir un immeuble de quatre niveaux comprenant six appartements, ainsi que des caves et des places de parc couvertes. Il avait la particularité de prévoir l’entrée du bâtiment à un niveau intermédiaire (cote +0.00), entre le 2e (cote -1.40) et le 3e étage (cote +1.40), où il était prévu d’aménager un local technique et un local commun. La demande tablait sur un bonus d’indice d’utilisation du sol de 15 %, car la construction devait remplir les conditions lui permettant d’obtenir le label Minergie, ce qui portait la surface brute de plancher utilisable à 653,20 m2.