B. Le 21 mars 2003, la Commission d’impôt pour les personnes morales (CIPM) a notifié à X. SA les taxations en vue des impôts cantonaux et communaux et de l’impôt fédéral direct des années fiscales 1997 à 2001. Ces taxations, qui tenaient compte des propositions susvisées du rapport de contrôle, ont été confirmées par décision sur réclamation du 6 janvier 2004.