L'indemnisation doit également comprendre les frais de défense, dans la mesure où il y a eu détention (RJN 7 II 251 cons.4). Le montant dû à ce titre peut être arrêté à 2'500 francs, ce qui correspond approximativement à l'indemnité d'avocat d'office supportée par l'Etat dans le cadre de l'assistance judiciaire totale dans l'affaire pénale. Cette somme, dont l'Etat est débiteur, pourra être compensée avec la créance que ce dernier possède contre le requérant en application de l'article 21 al.1 LAJA.
6. Le requérant, qui obtient gain de cause, a droit à des dépens pour les frais d'avocat engagés pour la présente procédure.