Adopté le 30 septembre 2005 par le Conseil communal de la Ville de Neuchâtel (ci-après : le conseil communal), le plan de quartier a été approuvé par le département le 23 décembre 2005 et mis à l'enquête publique du 20 janvier au 20 février 2006. Il a soulevé plusieurs oppositions, dont celles de X1. et de l'association X2. Le dossier du plan de quartier a été complété par une notice complémentaire sur le bruit du trafic routier établie le 25 juin 2007 par B. SA (ci-après : RIE-3).