Par
ces motifs,
LA COUR PENALE
Vu l'article 366 CPP
1. Rejette la demande de non-entrée en matière partielle du Ministère public.
2. Admet l'appel, annule le jugement du 16 août 2012 et renvoie la cause au Tribunal criminel des Montagnes et du Val-de-Ruz, pour nouveau jugement au sens des considérants.
3. Laisse les frais de la procédure de recours à la charge de l'Etat.
4. Dit que l'indemnité d'avocat d'office due au mandataire de l'appelant, à fixer dans une décision séparée, ne sera pas remboursable et restera définitivement à charge de l'Etat.
5.