L'ordonnance entreprise doit dès lors être annulée, le dossier étant renvoyé au Ministère public pour éclaircir la situation de fait, par l'ouverture d'une instruction et procéder aux investigations susmentionnées, dans la mesure de leur utilité successive. Vu l'issue de la cause, les frais judiciaires sont laissés à la charge de l’État (art. 428 al. 4 CPP). Il y a en outre lieu d’allouer une indemnité de dépens au recourant (art. 436 al. 3 CPP) par analogie.
Par ces motifs,
l'Autorité de recours en matière pénale
1. Annule l’ordonnance de non-entrée en matière du 7 octobre 2013 et renvoie la cause au Ministère public au sens des considérants.
2.