.Par
ces motifs,
l'Autorité de recours en matière pénale
1. Admet le recours et annule la décision du 28 août 2012.
2. Laisse les frais à la charge de l'Etat.
Neuchâtel, le 26 octobre 2012
1 Le ministère public ordonne le classement de tout ou partie de la procédure:
a. lorsqu'aucun soupçon justifiant une mise en accusation n'est établi;
b. lorsque les éléments constitutifs d'une infraction ne sont pas réunis;
c. lorsque des faits justificatifs empêchent de retenir une infraction contre le prévenu;
d. lorsqu'il est établi que certaines conditions à l'ouverture de l'action pénale ne peuvent pas être remplies ou que des empêchements de procéder sont apparus;