Pour respecter la procédure prévue à l'article 318 al. 1 CPP, le procureur devait aviser les parties de la clôture prochaine de l'instruction, les inviter à formuler leurs réquisitions de preuves et leur faire part de son intention de rendre une ordonnance de classement en faveur de Y. Il s'ensuit que l'ordonnance du 8 octobre 2012 doit être annulée et la cause renvoyée au ministère public pour qu'il suive la procédure prévue par la loi en matière de classement.
3. Au vu de ce qui précède, le recours doit être admis et les frais de justice laissés à la charge de l'Etat.