Le 23 septembre 2011, le ministère public a rendu une ordonnance de classement pour insuffisance de charges de la procédure pénale dirigée contre inconnu, en laissant les frais à la charge de l’Etat. Il a relevé qu'il ressortait des auditions menées par la police qu'un changement de structure était intervenu au sein de Y. Sàrl, qui n'avait cependant pas influencé directement le travail de la plaignante selon B., même si la plaignante avait dû, depuis lors, « rapporter » directement à un autre supérieur, A. expliquant pour sa part que ces réformes étaient dictées par l’évolution de l’entreprise et que leur influence sur le travail de la plaignante demeurait très subjective ;