A. Par ordonnance du 20 octobre 2010, X. a été renvoyé devant le Tribunal de police de Boudry pour infraction à une disposition du règlement sur l'exercice de la pêche dans le canton de Neuchâtel. Le Ministère public a requis contre lui une amende de 1'000 francs. Par jugement du 23 février 2011, X. a été acquitté et les frais ont été laissés à la charge de l'Etat.
B. Le 9 mars 2011, X. a adressé au Tribunal de police de Boudry une requête tendant au versement par l'Etat d'une indemnité pour "les dépenses occasionnées par l'exercice raisonnable de ses droits de procédure" (art.