X. SA conclut principalement à ce que la décision attaquée soit annulée; à ce que le tribunal civil soit enjoint d'instruire sans retard la procédure après prélèvement de l'avance de frais auprès de Y.; subsidiairement, à ce que la cause soit retournée au tribunal civil pour nouvelle décision au sens des considérants et, dans tous les cas, à ce que tout opposant soit condamné aux frais et dépens et débouté de toutes autres conclusions.
Le juge du tribunal civil a présenté ses observations le 12 février 2015.