A. X. (ci-après : le recourant), agriculteur, exploite une entreprise agricole à Y. En mars 2003, il a déposé une demande de subvention au Service de l'économie rurale pour la construction d'un nouveau rural à Y. A l'appui de sa requête, il a déposé un projet comprenant les plans d'un nouveau bâtiment ainsi que l'estimation du coût du projet. Le plan, reçu le 18 mars 2003 et daté du 12 février 2003, porte sur un rural de 34 m de long et de 21.35 m de large. Il prévoit notamment 30 logettes pour bovins ainsi qu'un box à veaux.