Selon le système et le but du Code de procédure pénale jurassien, le juge a ainsi la faculté de faire supporter au prévenu acquitté, en tout ou en partie, les conséquences pécuniaires d'un comportement fautif qui aurait provoqué l'action pénale ou en aurait compliqué le cours, qu'il s'agisse des frais, des dépens ou de l'indemnité due pour le tort matériel ou moral (ATF du 20 avril 1998 publié in RJJ 1998, p. 182ss).