B. a. Le 28 mars 2013, l’office fédéral de l’environnement (ci-après : OFEV) a publié un complément à la recommandation d’exécution de 2002 de l’ordonnance sur la protection contre le rayonnement non ionisant du 23 décembre 1999 (ORNI -RS 814.710) pour les stations de base pour téléphonie mobile et raccordements sans fil, qui précisait notamment la notion de « modification » au sens du ch. 62 al. 5 annexe 1 ORNI. Il s’agissait d’adaptations pouvant augmenter l’intensité du rayonnement reçue dans des lieux à utilisation sensible (ci-après : LUS) ou modifier sa distribution spatiale.