Partant, le recours est fondé et doit être admis. Le chiffre 2 de l'ordonnance querellée
sera donc annulé, les frais de la procédure devant le Ministère public, pour les faits
ayant donné lieu à l'ordonnance de classement partiel, devant être laissés à la charge
de l'État.

3.4. Corrélativement, une indemnité aurait pu être octroyée au recourant pour la
procédure préliminaire, le sort des frais préjugeant celui de l'indemnisation
(ATF 144 IV 207 consid. 1.8.2 et 137 IV 352 consid. 2.4.2).