En parallèle, le tunnel de Champel a été creusé entre mars 2014 et le 8 juin 2017.
Les travaux ont consisté dans le percement du tunnel depuis les deux extrémités, à
l'aide de pelles mécaniques; la consolidation de la future voûte du tunnel, réalisée
à l'aide de tubes métalliques insérés dans le terrain sur environ un mètre; le
soutènement, avec du béton projeté sur la paroi de la voûte au fur et à mesure de
l'avancement du perçage, le revêtement du tunnel (travaux d'étanchéité) et la
création des sorties de secours. Entre mars et juin 2016, le forage se situait à la
hauteur de la gare Champel-Hôpital.