Le 29 septembre 1998, il a été victime d'un accident alors qu'il était engagé par D.________ et travaillait pour E.________ AG. Il a souffert d'une entorse de l'épaule gauche et d'une fracture du trochiter. Il a ensuite travaillé à 100 % auprès de F.________ SA, du 1er septembre 2003 au 1er mars 2006. A ce titre, il était affilié à B.________ (ci-après la Fondation), pour la couverture de son deuxième pilier. Le 23 octobre 2003, il a été victime d'un second accident qui a été considéré comme une rechute de celui de 1998. Il a souffert d'une nouvelle contusion au niveau de l'épaule gauche entraînant une incapacité totale de travailler.