Zusammenfassung des Sachverhalts:
A. Das Paul Scherrer Institut Villigen und Würenlingen, vertreten
durch Bauten Forschungsanstalten, veröffentlichte im Schweizerischen
Handelsamtsblatt (SHAB) einen Bauauftrag betreffend die Teilsanierung eines
Laborgebäudes. Unter BKP 272 wurden die Metallbauarbeiten ausgeschrieben.
Die X AG reichte für die erwähnten Metallbauarbeiten am 6. Juni 2003 eine
Offerte ein mit einem Nettobetrag von Fr. 42’574.65. Nach entsprechender
Aufforderung der Vergabestelle vom 4. Juli 2003 legte auch die X AG am
7. Juli 2003 ein Abgebot in Höhe von Fr. 39’329.15 (inklusive Skontoabzug
von Fr. 1’923.75) ein.