Zusammenfassung des Sachverhalts:
A. Am 27. August 2003 meldete die X. AG im Auftrag der Y., Finance Division,
(…), beim Zollamt Z. eine Sendung rostfreien Stahl mit Geleitschein 11.51
Nr. (…) zum Transit an. Als Bestimmungszollstelle war das Zollamt Genf
und als Transitfrist der 4. September 2003 vermerkt. Die Sendung wurde
am 28. August 2003 bei der Y. in (…) abgeladen. Da der Geleitschein
in der Folge ungelöscht geblieben ist, wurde keine Einfuhrverzollung
vorgenommen. Das Zollamt Z. wandelte das Transitdokument daraufhin
wegen fehlender Geleitscheinlöschung innerhalb der Transitfrist in
eine definitive Einfuhrverzollung um (Einfuhrzoll-/MWST-Ausweis Nr.
[…] vom 15. Ok­tober 2003).