6 al. 3 de l’ordonnance du 25 novembre 1998 sur l’organisation du gouvernement et de l’administration (OLOGA, RS 172.010.1), les Ecoles polytechniques fédérales et le Conseil des écoles polytechniques fédérales constituent des unités de l’administration fédérale décentralisée rattachées au Département fédéral de l’intérieur, c’est-à-dire des unités dépendant d’une même collectivité. D’une analyse des textes de loi spécifiques régissant le domaine, il ressort tout d’abord, de manière générale, en vertu de l’art. 4 de la loi sur les EPF, que les écoles polytechniques fédérales sont subordonnées au Conseil des EPF et celui-ci au Département fédéral de l’intérieur.