Les épisodes ont plusieurs fois évoqué la cause antiséparatiste, notamment par le biais d’enregistrements d’archives. Un soin particulier a été apporté à l’explication des causes, notamment confessionnelles, qui ont poussé les habitants des districts du Sud à adopter une autre position que ceux du Nord. On relèvera ici à titre d’exemple l’entretien avec Alain Pichard et l’interview nuancée de Roger Louis Junod, dans laquelle celui-ci explique pourquoi il avait été séduit par les leaders séparatistes, mais où il souligne également qu’il ne s’est jamais senti persécuté par Berne.