Hormis les modifications pouvant être entreprises par les comités mixtes (cf. ci-dessous), tout changement apporté aux accords doit s’effectuer par voie de modification du traité. Tous les traités conclus avec la CE s’appliquent sur l’intégralité du territoire de l’Union, pour autant qu’ils ne contiennent aucune disposition dérogatoire à cet égard. Il en va différemment des accords mixtes, qui doivent non seulement être approuvés par la Communauté mais aussi par chacun des Etats membres signataires ; les nouveaux Etats membres doivent formellement adhérer à l’accord32.