Am 31. März 2008 reichte die Klägerin am Handelsgericht des Kantons
Zürich die Klageschrift mit folgendem Rechtsbegehren ein (act. 2_1):

„1. Es sei festzustellen, dass der schweizerische Anteil des Europäischen
Patents EP-B 1 175 904 nichtig ist.

2. Es sei das Institut für geistiges Eigentum anzuweisen, die Löschung
des schweizerischen Anteils des Europäischen Patents EP-B 1 175 904
im schweizerischen Patentregister vorzunehmen.

3. Unter Kosten- und Entschädigungsfolgen zulasten der Beklagten, einschliesslich der Kosten für den notwendigerweise beigezogenen Patentanwalt.“

2.