Im Auftrag der Schweizerischen Konferenz der kantonalen Gesundheitsdirektorinnen und -direktoren (GDK) koordiniert SWT auch die Aufgaben, die den Kantonen durch das Transplantationsgesetz zugewiesen werden. Schliesslich nimmt sie im Auftrag des Schweizerischen Verbandes für Gemeinschaftsaufgaben der Krankenversicherer (SVK) und des nationalen Spitalverbandes H+ auch ein Mandat im Zusammenhang mit der Kostenermittlung und der Finanzierung von Transplantationen sowie mit logistischen Aspekten wahr.