B.
B.a. Par acte du 29 septembre 2025, A.________ (ci-après: le recourant) interjette un recours au Tribunal fédéral. Il prend notamment les conclusions suivantes:
"
Principalement
II. Annuler et mettre à néant l'arrêt AARP/688/2025 du 28 août 2025 rendu par la Chambre pénale de recours et notifié le 29 août 2025 dans la procédure P/20359/2021.
Cela fait et statuant à nouveau,
III. Ordonner la mise en liberté provisoire immédiate [du recourant].
IV. Prononcer les mesures de substitution suivantes:
i. dépôt en mains du Tribunal criminel de ses documents d'identité;
ii. interdiction de quitter le territoire suisse;
iii.