Le 13 juillet 2022, la personne responsable des autorisations (ci-après: la responsable des autorisations) auprès de A.________ SA a transmis les dossiers sollicités à l'OFDF. Sur les 28 dossiers, deux présentaient un vice de forme, à savoir que pour les envois des 7 mai 2018 (n° de déclaration xxx) et 6 septembre 2021 (n° de déclaration yyy), les certificats de circulation des marchandises EUR n'avaient pas été authentifiés par les douanes irlandaises au moment de l'exportation des marchandises. Dans les deux cas, le taux préférentiel avait en outre été revendiqué à tort.
A.b.