Die Durchführungsphase eines prospektiven Forschungsprojektes lässt sich in mehrere Unterabschnitte gliedern. Stark vereinfacht folgen auf die Rekrutierung die eigentliche Intervention (z.B. die Verabreichung des Prüfpräparats) und schliesslich die Datenerhebung oder Materialentnahme zum Zweck der Messung der Interventionswirkung. Daran schliessen die Auswertung der Resultate und allenfalls die Publikation der Studie an. Die Durchführung eines
prospektiven Forschungsprojektes mit Personen, namentlich eines klinischen Versuchs, beginnt typischerweise mit der Rekrutierung der teilnehmenden Personen (z.B. Inseratschaltung,
Kontaktierung durch behandelnde Ärzte).