1. Le recours du 30 décembre 2019 est rejeté. La décision du 29 novembre 2019 de la commune de Saint-Imier est modifiée d'office dans le sens que la demande de modification du projet selon le plan du 25 septembre 2019 est rejetée et qu'un délai au 31 mai 2021 pour le rétablissement de l'état conforme est imparti. Pour le surplus, la décision de la commune de Saint-Imier 29 novembre 2019 est confirmée. 2. Les frais de procédure, fixés à fr. 1000, sont mis à la charge de la recourante. Une facture séparée lui sera notifiée dès l'entrée en force de la présente décision.