1. Le recours est admis partiellement dans la mesure où il est recevable.

Les chiffres 2 et 2.4 sont modifiés d'office et le chiffre 2.3 est modifié comme il suit:

2. L'état conforme à la loi doit être rétabli comme suit – toutes les obligations s'adressant
aussi bien à A.________ SA qu'au propriétaire ou à la propriétaire du bien-fonds:
(ch. 2.1 et 2.2 non modifiés)